法人本部
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　研究事業部

農業研究本部
　研究本部
　企画調整部
　中央農業試験場
　上川農業試験場
　道南農業試験場
　十勝農業試験場
　北見農業試験場
　酪農試験場
　畜産試験場
　花・野菜技術センター

水産研究本部
　研究本部
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　中央水産試験場
　函館水産試験場
　釧路水産試験場
　網走水産試験場
　稚内水産試験場
　栽培水産試験場
　さけます・内水面水産試験場

森林研究本部
　研究本部
　企画調整部
　林業試験場
　林産試験場

産業技術環境研究本部
　研究本部
　企画調整部
　ものづくり支援センター
　工業試験場
　食品加工研究センター
　エネルギー・環境・地質研究所

建築研究本部
　研究本部
　企画調整部
　建築性能試験センター
　北方建築総合研究所